Yükselin evine giderek arama yapan ve herhangi bir suç unsuruna rastlayamayan polisler, hakkında şikayet olduğundan kendileri ile polis merkezine gelmesini söyledi. Polis merkezinde ifadesi alınan Yüksel, daha sonra sağlık kontrolünden geçirildi. Savcılığa çıkarılmak üzere yeniden polis merkezine götürülen Yüksel, iddiaya göre, nezarethaneye gireceği sırada belindeki kemerinin çıkarılması istendi. Bir anda panik yaparak kaçmak isteyen Yükselin ayağı takılınca yere düştü.
Polisler tarafından yakalanarak nezarethaneye konulan Yüksel, bir süre sonra rahatsızlanması üzerine Zonguldak Atatürk Devlet Hastanesine kaldırıldı.
Acil Servis doktorları tarafından yapılan incelemesinde Yükselin ölmüş belirlendi. Yükselin cesedi, otopsi için İstanbul Adli Tıp Kurumuna gönderildi.
Yükselin ağabeyi Ömer Yüksel, gazetecilere, acil servis doktorlarının, kardeşinin hastaneye götürüldüğünde ölü olduğunun kendisine söylediklerini belirterek, gelecek otopsi sonucuna göre, olayda ihmalin olduğunun belirlenmesi durumunda suç duyurusunda bulunacaklarını kaydetti.
İl Emniyet Müdürü Atilla Çınar, AA muhabirine, cumhuriyet savcılığının olayla ilgili soruşturmayı yürüttüğünü, Metin Yükselin kesin ölüm nedeninin otopsi sonucunda ortaya çıkacağından, şu anda bir şey söylemenin yanlış olacağını kaydetti.